Los departamentos didácticos son los órganos básicos encargados de organizar y desarrollar las enseñanzas propias de las áreas, materias o módulos que tengan asignados, y las actividades que se les encomienden dentro del ámbito de sus competencias.    Elaboran, antes del comienzo del curso académico, la programación didáctica de las enseñanzas integradas en él, bajo la coordinación y dirección del jefe del mismo, y de acuerdo con las directrices generales establecidas por la Comisión de Coordinación Pedagógica.

       Otros órganos de coordinación docente cuyas funciones son también trascendentes en el Instituto son los departamentos de orientación y el de actividades complementarias y extraescolares.

       El departamento de orientación se encarga de la orientación educativa, psicopedagógica y profesional de los alumnos, contribuye al desarrollo del plan de acción tutorial y asume la evaluación psicológica y pedagógica del alumnado.
  
       El departamento de actividades complementarias y extraescolares se encarga de promover, organizar y facilitar este tipo de actividades.